35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05481 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  67.63 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  67.63 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  67.63 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  67.63 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  36.5 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  31.85 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  25.9 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  26.47 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  26.47 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  25.18 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  25.74 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  29.63 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  27.21 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  28.37 
 
 		 272 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  30.22 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  29.63 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  28.99 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  28.26 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  28.26 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  26.81 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  27.91 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  26.67 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  26.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  27 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  26.11 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  25.87 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  32.31 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  21.83 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>