41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0340 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  292  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  37.23 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  37.23 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  37.23 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  36.5 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  30.88 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  30.88 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  30.15 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0052  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1503  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1161  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0419  hypothetical protein  26.67 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2695  hypothetical protein  25.93 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1608  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  28 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0649  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.62119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  24.44 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  24.44 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  27.21 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  23.19 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  38.57 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  28.79 
 
 		 173 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  26.73 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0615  hypothetical protein  22.46 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.218761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3078  hypothetical protein  21.74 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0586  hypothetical protein  21.74 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  21.74 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  28.07 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.6815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>