25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3691 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  35.17 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  33.82 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  33.82 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  33.82 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  29.71 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  33.58 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  30.37 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  27.21 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  24.63 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  26.87 
 
 		 152 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0330  hypothetical protein  28.8 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26978  normal  0.735549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4952  hypothetical protein  25.2 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.943323 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  28.93 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  28.93 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5024  hypothetical protein  26.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179023  normal  0.0893042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5260  hypothetical protein  26.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3343  hypothetical protein  26.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  28.93 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  28.1 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>