28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0346 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  299  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3691  hypothetical protein  35.17 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635794  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6086  hypothetical protein  38.76 
 
 		 152 aa  93.2  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0847593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  37.78 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  37.78 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  35.34 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  36.5 
 
 		 155 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  28.47 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0311  hypothetical protein  35.97 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.6815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0323  hypothetical protein  35.25 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.043806 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0320  hypothetical protein  35.25 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.726183  normal  0.0158521 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  31.06 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0330  hypothetical protein  29.03 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26978  normal  0.735549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  26.24 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  32.33 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1435  hypothetical protein  31.79 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1282  hypothetical protein  24.44 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2569  hypothetical protein  32.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1321  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967147  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1402  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05481  hypothetical protein  21.74 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1268  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0510  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0239  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0648  hypothetical protein  25.71 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>