12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3016 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3016  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  556  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3427  hypothetical protein  30.45 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2759  hypothetical protein  28 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  24.29 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0168  hypothetical protein  23.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01150  hypothetical protein  23.97 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0340  hypothetical protein  26.73 
 
 		 140 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  22 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  22.94 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  22.94 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  22.86 
 
 		 173 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  22.86 
 
 		 155 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>