15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1466 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  333  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2704  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  275  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.608865  normal  0.0263115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  28.03 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6211  hypothetical protein  27.03 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  24.83 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  25.5 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  25.5 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2839  hypothetical protein  28.29 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  22.82 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  22.82 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  20.67 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0498  hypothetical protein  25.77 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3346  hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.891873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0482  hypothetical protein  23.53 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>