13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0498 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0498  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3346  hypothetical protein  89.94 
 
 
165 aa  273  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.891873  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0482  hypothetical protein  89.94 
 
 
159 aa  273  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1282  hypothetical protein  26.45 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2519  hypothetical protein  27.27 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2616  hypothetical protein  29.22 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3107  hypothetical protein  29.22 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4985  hypothetical protein  28.76 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0329  hypothetical protein  26.14 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0402  hypothetical protein  26.14 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1354  hypothetical protein  25.77 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1466  hypothetical protein  25.77 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0647  hypothetical protein  25.49 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000601182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>