More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1513 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1513  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.03 
 
 
213 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.371589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.76 
 
 
193 aa  259  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159588  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1905  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.13 
 
 
238 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.339028  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
249 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
249 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.62 
 
 
246 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
238 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.79 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 
311 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.96 
 
 
301 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.35 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.35 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.96 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.22 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  35.6 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.68 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.83 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.05 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.76 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
303 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
301 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.75 
 
 
309 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
303 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.38 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 
238 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.82 
 
 
299 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.06 
 
 
247 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.6 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.02 
 
 
242 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.41 
 
 
232 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.32 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.62 
 
 
242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.62 
 
 
242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.62 
 
 
242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  33.49 
 
 
307 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.62 
 
 
242 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.25 
 
 
238 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.62 
 
 
242 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.67 
 
 
234 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.54 
 
 
238 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.62 
 
 
246 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.38 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.23 
 
 
262 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.22 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  60.22 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  34.43 
 
 
242 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  32.72 
 
 
262 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.32 
 
 
243 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.95 
 
 
238 aa  106  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.89 
 
 
243 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54 
 
 
238 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.31 
 
 
254 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.38 
 
 
355 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
201 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.89 
 
 
233 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  53.19 
 
 
235 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.29 
 
 
242 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.19 
 
 
235 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.04 
 
 
253 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.6 
 
 
243 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
244 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.88 
 
 
253 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.06 
 
 
218 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  41.18 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
244 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  59.34 
 
 
250 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  41.18 
 
 
239 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.11 
 
 
244 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.98 
 
 
236 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.63 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.94 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.96 
 
 
254 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
244 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0442  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  51.06 
 
 
218 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.256552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.6 
 
 
243 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0219  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.31 
 
 
241 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.748984  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.6 
 
 
243 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
242 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2482  TonB system transport protein ExbB  43.08 
 
 
242 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.12 
 
 
243 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2288  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.08 
 
 
255 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.018697  decreased coverage  0.0000321635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.26 
 
 
222 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.89 
 
 
243 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5226  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
239 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.67 
 
 
242 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  43.51 
 
 
254 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
222 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0296  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.08 
 
 
239 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0686936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
222 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.48 
 
 
238 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.48 
 
 
238 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.46 
 
 
222 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.94 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.2 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>