48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3928 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  100 
 
 
209 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  64.88 
 
 
192 aa  270  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  59.09 
 
 
218 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  57.21 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  57.69 
 
 
221 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  59.09 
 
 
209 aa  208  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.28 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  46.46 
 
 
200 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  45.45 
 
 
200 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  44.39 
 
 
199 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  41.5 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  41.12 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  41.62 
 
 
188 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  37.19 
 
 
187 aa  111  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  32.84 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  37.7 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.71 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  29.06 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.59 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.79 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.01 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.33 
 
 
168 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.33 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.22 
 
 
180 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.43 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.65 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.22 
 
 
166 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  29.41 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  32.09 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.09 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.86 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  32.46 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  32.11 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  31.05 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  31.05 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  31.52 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  31.75 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  31.22 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  25.7 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  32.28 
 
 
1644 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>