47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2108 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  100 
 
 
190 aa  376  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  97.37 
 
 
223 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  97.37 
 
 
223 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  96.84 
 
 
190 aa  336  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  76.32 
 
 
180 aa  284  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  76.84 
 
 
215 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  69.79 
 
 
192 aa  267  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  69.79 
 
 
192 aa  266  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  69.27 
 
 
192 aa  264  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  68.23 
 
 
193 aa  262  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  68.23 
 
 
193 aa  262  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  67.71 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  67.71 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  74.01 
 
 
170 aa  253  8e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  67.96 
 
 
193 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  67.96 
 
 
193 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  67.96 
 
 
193 aa  248  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  68.75 
 
 
168 aa  235  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  68.18 
 
 
168 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.52 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.52 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.07 
 
 
166 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  37.57 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  38.46 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  38.12 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.31 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  40 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.75 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  29.44 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  36 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  33.52 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  30.77 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  31.89 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  31.11 
 
 
221 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  30.43 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  30.98 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  30.98 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  34.45 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  32 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  28.73 
 
 
218 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  28.49 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  32.8 
 
 
234 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  27.32 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  31.2 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1557  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.29 
 
 
61 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.225701  hitchhiker  0.0000912781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  33.6 
 
 
209 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  32 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>