46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2875 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  95.29 
 
 
192 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  96.34 
 
 
192 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  95.81 
 
 
192 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  94.76 
 
 
192 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  95.81 
 
 
192 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  94.79 
 
 
193 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  95.56 
 
 
193 aa  349  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  94.44 
 
 
193 aa  348  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  94.44 
 
 
193 aa  348  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  66.15 
 
 
190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  65.62 
 
 
190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  65.1 
 
 
223 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  65.1 
 
 
223 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.38 
 
 
180 aa  221  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.85 
 
 
215 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.33 
 
 
170 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.74 
 
 
168 aa  197  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.18 
 
 
168 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.17 
 
 
180 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.17 
 
 
180 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 
166 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  36.76 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.48 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  36.36 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.87 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  37.91 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  34.76 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1557  bacteriophage lambda tail assembly protein I  70.45 
 
 
61 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.225701  hitchhiker  0.0000912781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  33.88 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  31.69 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  30.22 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  32.09 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  31.21 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  29.26 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  31.15 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  31.15 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  30.11 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  32.33 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  29.26 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.77 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  27.23 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  29.47 
 
 
234 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  26.84 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  28.42 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  33.82 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>