46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2577 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  91.37 
 
 
209 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  79.33 
 
 
218 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  58.73 
 
 
200 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  57.14 
 
 
200 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  60.75 
 
 
192 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  53.73 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  52.76 
 
 
206 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  51.01 
 
 
199 aa  168  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  47.72 
 
 
221 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  44.56 
 
 
194 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  40.21 
 
 
200 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  43.41 
 
 
187 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  43.92 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  33.5 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  39.18 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  34.41 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.74 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.56 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  32.97 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  32.97 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  31.72 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.76 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  32.61 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.9 
 
 
168 aa  61.6  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  31.61 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  27.98 
 
 
180 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  31.09 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.33 
 
 
180 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  27.94 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  27.94 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  32.07 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.61 
 
 
166 aa  55.1  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.85 
 
 
180 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.51 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.6 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.51 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.51 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.51 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.89 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  29.6 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.89 
 
 
192 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  28.96 
 
 
192 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  28.96 
 
 
192 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  28.42 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  28.96 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>