47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2941 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  91.28 
 
 		 212 aa  354  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  78.37 
 
 		 218 aa  321  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  60.32 
 
 		 200 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  57.67 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  59.68 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  56.06 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  55.84 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  50.51 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  48.97 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  46.63 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  43.3 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  45.6 
 
 		 187 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  46.03 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  39.77 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  35.33 
 
 		 189 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  32 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.28 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.64 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.62 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.62 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  32.07 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  30.98 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  30.98 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  30.43 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  29.85 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  29.85 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.24 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  30.37 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  31.22 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  30.98 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.98 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.98 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.98 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.2 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  31.2 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.82 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  29.82 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.13 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.86 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.89 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.86 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.89 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.29 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.29 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.35 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  25.7 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>