41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1157 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  98.89 
 
 
180 aa  357  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  99.4 
 
 
166 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  58.33 
 
 
190 aa  194  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  57.74 
 
 
223 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  57.74 
 
 
223 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.39 
 
 
180 aa  191  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.95 
 
 
192 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.25 
 
 
168 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.14 
 
 
190 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.62 
 
 
215 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.76 
 
 
193 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.36 
 
 
192 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.62 
 
 
168 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.36 
 
 
192 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.17 
 
 
192 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60 
 
 
170 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.17 
 
 
193 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.17 
 
 
192 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.12 
 
 
193 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.12 
 
 
193 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.12 
 
 
193 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  41.74 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  39.06 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  36.57 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  40.52 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  37.39 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  38.79 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  41.09 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  35.25 
 
 
218 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  33.61 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  38.1 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  41.89 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  32.5 
 
 
221 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  34.21 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  34.15 
 
 
212 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  34.78 
 
 
209 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  33.61 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  31.43 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  34.71 
 
 
209 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  30 
 
 
1644 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>