47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1693 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 
188 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  93.58 
 
 
194 aa  350  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  73.12 
 
 
187 aa  267  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  56.99 
 
 
200 aa  200  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  52.82 
 
 
206 aa  181  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  52.85 
 
 
200 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  51.31 
 
 
200 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  48.17 
 
 
199 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  44.56 
 
 
221 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  43.52 
 
 
218 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  43.92 
 
 
212 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  46.03 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  39.27 
 
 
192 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  39.29 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  35.45 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  39.69 
 
 
215 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  36.7 
 
 
189 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  37.87 
 
 
187 aa  92  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  34.72 
 
 
195 aa  92  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  38.12 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  38.12 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  34.92 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  35.33 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  36.9 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  36.36 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  36.36 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.57 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  34.92 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.02 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.79 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.02 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.02 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.1 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  36.67 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.1 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.1 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.1 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.04 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.67 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.95 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.95 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  39.32 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  39.32 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  38.79 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.07 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  37.93 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  30.48 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>