48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0881 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  99.48 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  97.38 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  97.38 
 
 		 192 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  96.86 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  94.27 
 
 		 193 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  93.19 
 
 		 192 aa  363  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  92.67 
 
 		 192 aa  362  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  97.41 
 
 		 193 aa  360  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  66.67 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  66.15 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  66.15 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  66.15 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.9 
 
 		 180 aa  220  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.38 
 
 		 215 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.44 
 
 		 170 aa  203  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.87 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.3 
 
 		 168 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.76 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.76 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 		 166 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  35.6 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  35.79 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  33.33 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.95 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1557  bacteriophage lambda tail assembly protein I  72.73 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.225701  hitchhiker  0.0000912781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  33.33 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  35.83 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  31.22 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  31.38 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  31.69 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  30.77 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  28.49 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  28.72 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  29.26 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  33.08 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.22 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  30.05 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  30.05 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  29.03 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  27.13 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  29.51 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  26.6 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  29.53 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  30.43 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  35.29 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  30.3 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>