40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1422 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 		 166 aa  331  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  99.4 
 
 		 180 aa  328  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  99.4 
 
 		 180 aa  328  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  59.73 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  63.31 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  59.06 
 
 		 223 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  59.06 
 
 		 223 aa  169  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  62.41 
 
 		 215 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.06 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.54 
 
 		 170 aa  168  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  61.54 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.84 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.74 
 
 		 192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.74 
 
 		 192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  59.74 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  58.44 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.64 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.64 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  57.64 
 
 		 193 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  41.74 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  39.06 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  36.84 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  40.52 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  38.79 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  37.39 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  41.09 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  33.61 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  35.25 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  38.1 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  43.24 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  32.5 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  34.21 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  34.15 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  34.78 
 
 		 209 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0444  phage protein tail protein  31.43 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  33.61 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  34.71 
 
 		 209 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>