45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2797 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  99.4 
 
 		 168 aa  337  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  78.57 
 
 		 215 aa  269  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  77.98 
 
 		 170 aa  268  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  69.64 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  66.48 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  66.48 
 
 		 223 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  66.48 
 
 		 190 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  65.91 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.74 
 
 		 192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.18 
 
 		 193 aa  195  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.74 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.74 
 
 		 193 aa  194  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  56.18 
 
 		 192 aa  194  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.62 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  55.06 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  55.06 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.62 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  55.69 
 
 		 193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  55.69 
 
 		 193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  54.49 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1422  bacteriophage lambda tail assembly protein I  60.84 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.0460602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  41.03 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  36.2 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  45.31 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  36.75 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  36.8 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  38.46 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  34.11 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  36.44 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0093  phage tail assembly protein  33.33 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2577  lambda tail assembly I  33.62 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2774  bacteriophage lambda tail assembly I  32.48 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0113451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  38.33 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  39.32 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  31.21 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  31.25 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  30.57 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  30.57 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  30 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  30 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  29.52 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  29.7 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2941  prophage LambdaSo, tail assembly protein I  33.62 
 
 		 209 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3928  lambda tail assembly I  30.33 
 
 		 209 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>