40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3976 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3976  putative phage HK022 GP20-related protein  100 
 
 		 234 aa  473  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5048  lambda tail assembly I  37.62 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4058  lambda tail assembly I  37.62 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5751  lambda tail assembly I  37.13 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3528  lambda tail assembly I  36.76 
 
 		 189 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3881  lambda tail assembly I  36.76 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6223  lambda tail assembly I  37.25 
 
 		 195 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7023  lambda tail assembly I  37.25 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1696  phage HK022 GP20-like protein  35.05 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151156  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3881  lambda tail assembly I  31.31 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678643  normal  0.876143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1202  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.08 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00399274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1061  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.28 
 
 		 194 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0580385  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2376  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.46 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0997408  normal  0.405463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1471  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.29 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00749  hypothetical protein  33.02 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10053  tail component  33.02 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3122  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.74 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0875771 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2764  bacteriophage lambda tail assembly protein I  34.74 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1693  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.48 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.795046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2875  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.16 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2108  lambda tail assembly I  32.8 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000153192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2220  bacteriophage lambda tail assembly I  30.52 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1637  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.8 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.344026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1876  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.11 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2169  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.16 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.309282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3190  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.11 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000623151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1800  bacteriophage lambda tail assembly protein I  32.82 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.193509  normal  0.0258955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1092  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.16 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0881  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.16 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1199  bacteriophage lambda tail assembly protein I  33.16 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0912  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.21 
 
 		 170 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3383  lambda tail assembly I  27.45 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  hitchhiker  0.0000000000940412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0784  putative bacteriophage protein  28.9 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08280  putative bacteriophage protein  28.97 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.853655  hitchhiker  0.00000985213 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2628  lambda tail assembly I  26.52 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000966997  hitchhiker  0.000000125208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1157  bacteriophage lambda tail assembly protein I  31.48 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0707  bacteriophage lambda tail assembly protein I  28.49 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  hitchhiker  0.00919626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2425  bacteriophage lambda tail assembly I  28.17 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2797  bacteriophage lambda tail assembly protein I  27.93 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0963132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1085  bacteriophage lambda tail assembly protein I  30.86 
 
 		 180 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>