99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1849 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3514  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  100 
 
 		 92 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  100 
 
 		 92 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689524  normal  0.0371902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2226  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  98.91 
 
 		 92 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  96.74 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.810959  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  83.7 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  82.61 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  82.61 
 
 		 92 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  63.44 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  63.44 
 
 		 93 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  61.96 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4733  multiple resistance and pH regulation protein F  68.92 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3905  multiple resistance and pH regulation protein F  66.3 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1601  multiple resistance and pH regulation protein F  77.61 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3293  multiple resistance and pH regulation protein F  59.34 
 
 		 96 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  60.67 
 
 		 94 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  59.78 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  60 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  54.35 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  67.16 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  55.43 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  52.81 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  53.85 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  53.85 
 
 		 94 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  51.69 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  50.56 
 
 		 93 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  54.67 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3621  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  47.31 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0308607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1445  multiple resistance and pH regulation protein F  49.44 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5264  PH Adaption potassium efflux system  50.6 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0034  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  49.45 
 
 		 93 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2488  multiple resistance and pH regulation protein F  44.94 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  55.41 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  43.82 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  50.56 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  49.41 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.95 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  57.65 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0504  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  57.65 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  50.62 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  58.21 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4320  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  55.22 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0493  multisubunit Na+/H+ antiporter, subunit F  53.73 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  47.06 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.43 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50690  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.12 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  45.24 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04213  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.36 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  43.75 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3535  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  56.76 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  44.44 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  44.44 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0228  multiple resistance and pH regulation protein F  43.82 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.57 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.26 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  42.05 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0672  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.57 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  41.56 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.45 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3809  multiple resistance and pH regulation protein F  42.25 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.332403 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1104  multiple resistance and pH regulation protein F  45.31 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0102977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0701  multiple resistance and pH regulation protein F  41.56 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  34.78 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  39.51 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.37 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0187747  normal  0.214865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  33.75 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  36 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  34.67 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  34.15 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.51 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  38.81 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  35.56 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  32.84 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  43.37 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  28.89 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.76 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  39.13 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  37.5 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0286  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.71 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  36.51 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  29.41 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.38 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  37.29 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  41.18 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26970  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  33.71 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2972  multiple resistance and pH regulation protein F  41.27 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.11 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.29 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  36.49 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1640  multiple resistance and pH regulation protein F  37.31 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  30.3 
 
 		 97 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.84 
 
 		 117 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0839  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0665  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.71 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000841525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0650  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.71 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.58 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.567164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.85 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  31.25 
 
 		 90 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>