61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0667 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  52.94 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0166  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  55.95 
 
 		 95 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.49 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.912377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  55.95 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0594  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.57 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.57 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  47.56 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  44.05 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4890  multiple resistance and pH regulation protein F  44.94 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  46.84 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  46.25 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  45 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  46.88 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0346  putative cation antiporter subunit  40 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.503467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  42.86 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  39.29 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0498  multiple resistance and pH regulation protein F  46.25 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4626  multiple resistance and pH regulation protein F  41.25 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  43.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0093627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  34.48 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3869  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  34.29 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  33.73 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  36.71 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.58 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.810959  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  33.73 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3293  multiple resistance and pH regulation protein F  32.89 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.84 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0042  multiple resistance and pH regulation protein F  42.86 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.19 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  39.19 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0212  multiple resistance and pH regulation protein F  45.71 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.473082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18930  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  41.67 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  31.33 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2226  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.13 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  35.71 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.13 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689524  normal  0.0371902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3514  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.13 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.76 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.78 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  31.17 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  22.78 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.88 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2030  multiple resistance and pH regulation protein F  30.34 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  32.88 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  31.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.88 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.5 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  31.17 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.88 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  28.75 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.03 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  33.87 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  31.17 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2858  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.26 
 
 		 91 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  27.5 
 
 		 94 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  27.5 
 
 		 94 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.41 
 
 		 90 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>