93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0839 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0839  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  100 
 
 		 101 aa  192  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3452  multiple resistance and pH regulation protein F  79.55 
 
 		 93 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5158  multiple resistance and pH regulation protein F  73.61 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.716079  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2858  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  62.5 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3949  multiple resistance and pH regulation protein F  43.59 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3662  MnhF/PhaF family monovalent cation/proton antiporter  51.67 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.85894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1640  multiple resistance and pH regulation protein F  53.23 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0502  multiple resistance and pH regulation protein F  39.29 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119623  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3280  multiple resistance and pH regulation protein F  40.51 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2282  multiple resistance and pH regulation protein F  48.48 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.668808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2972  multiple resistance and pH regulation protein F  53.85 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0676635 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0885  multiple resistance and pH regulation protein F  49.25 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15072  normal  0.188818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.31 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  42.03 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0795  multiple resistance and pH regulation protein F  39.76 
 
 		 97 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2580  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.97 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0912  multiple resistance and pH regulation protein F  50 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000298723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.67 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0949  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.66 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0187747  normal  0.214865 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  39.68 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  34.52 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  39.74 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  39.68 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  36.36 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  42.86 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04213  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.38 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0665  multiple resistance and pH regulation protein F  35.29 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.29 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  32.18 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0099  multiple resistance and pH regulation protein F  32.93 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  38.98 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2736  multiple resistance and pH regulation protein F  37.5 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2523  multiple resistance and pH regulation protein F  38.46 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  33.82 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  39.39 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2668  multiple resistance and pH regulation protein F  45.83 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.31 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.88 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.34 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  34.92 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.1 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000561435  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  35.44 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.18 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.88 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.85 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  34.33 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2488  multiple resistance and pH regulation protein F  30.88 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.31 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  35.38 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.81 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0739  multiple resistance and pH regulation protein F  38.98 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2167  multiple resistance and pH regulation protein F  31.67 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1382  multiple resistance and pH regulation protein F  34.78 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.393681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2478  multiple resistance and pH regulation protein F  34.78 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.648417  normal  0.0636047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0493  multisubunit Na+/H+ antiporter, subunit F  31.34 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3293  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1392  multiple resistance and pH regulation protein F  38 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.76 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  34.78 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0896  multiple resistance and pH regulation protein F  30.51 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.297824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  30.88 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.79 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.810959  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.78 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.79 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.88 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0701  multiple resistance and pH regulation protein F  28.57 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.390785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  35 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  33.33 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3905  multiple resistance and pH regulation protein F  36 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  27.06 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.99 
 
 		 89 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  37.31 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  27.06 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3514  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689524  normal  0.0371902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  32.81 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  36.23 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  27.06 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1211  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.19 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  30.77 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0612  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.81 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.716984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.38 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.92 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  29.41 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4320  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.34 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409592  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.35 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2226  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.78 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4733  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 92 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50690  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.31 
 
 		 85 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>