78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6651 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6651  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  100 
 
 		 86 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.75 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0594  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.75 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.441545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0572  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  53.75 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.912377 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05190  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  51.43 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0166  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  51.25 
 
 		 95 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.569132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0740  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  51.25 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0667  multiple resistance and pH regulation protein F  46.25 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35420  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  50 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.279201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3183  multiple resistance and pH regulation protein F  50.79 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3718  multiple resistance and pH regulation protein F  45 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2435  multiple resistance and pH regulation protein F  45.71 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.38947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3814  multiple resistance and pH regulation protein F  50.77 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14790  Multiple resistance and pH regulation protein F (MrpF / PhaF)  44.19 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.62794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  45 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4626  multiple resistance and pH regulation protein F  48.81 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4890  multiple resistance and pH regulation protein F  44.19 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  41.33 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  38.55 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3656  hypothetical protein  36.9 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3869  hypothetical protein  42.35 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2097  multiple resistance and pH regulation protein F  40.26 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  39.24 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0346  putative cation antiporter subunit  51.67 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.503467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.51 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.94 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18930  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  44.05 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2339  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.8 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.962701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0498  multiple resistance and pH regulation protein F  50 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  43.08 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  37.66 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.33 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.18 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  36.71 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  34.92 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1773  multiple resistance and pH regulation protein F  38.16 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2858  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  43.59 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.810959  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.12 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3621  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.03 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0308607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.75 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40.51 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25160  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  41.67 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.0093627  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  41.43 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  34.15 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  36.71 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  41.89 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2226  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.31 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  38.46 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0042  multiple resistance and pH regulation protein F  49.18 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.231877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.75 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3514  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.31 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0286  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  35.82 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  40 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2215  multiple resistance and pH regulation protein F  40.51 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0795  multiple resistance and pH regulation protein F  34.48 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0650  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.62 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0665  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.62 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000841525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  42.31 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689524  normal  0.0371902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  35.9 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0839  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.38 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  35.9 
 
 		 94 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  35.9 
 
 		 94 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  35.44 
 
 		 92 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  33.75 
 
 		 90 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3733  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.5 
 
 		 94 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  38.46 
 
 		 92 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2927  multiple resistance and pH regulation protein F  32.1 
 
 		 87 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  0.611551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.67 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  30 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  31.03 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1542  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.86 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0184419 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  32.26 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  38.75 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>