78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26970  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  100 
 
 		 85 aa  158  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1917  multiple resistance and pH regulation protein F  60.56 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.851543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11090  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhF subunit  52.94 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1733  multiple resistance and pH regulation protein F  45.88 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2869  multiple resistance and pH regulation protein F  32.91 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0059  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.1 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0228  multiple resistance and pH regulation protein F  35.9 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0137  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.38 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.911502  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0996  pH adaption potassium efflux system, PhaF subunit  34.62 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2656  multiple resistance and pH regulation protein F  34.62 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3946  multiple resistance and pH regulation protein F  38.36 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2853  multiple resistance and pH regulation protein F  28.57 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1126  multiple resistance and pH regulation protein F  30 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00913548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19570  sodium hydrogen antiporter subunitF, ShaF  33.33 
 
 		 89 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2441  multiple resistance and pH regulation protein F  35.9 
 
 		 94 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.770309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1682  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.8 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.145705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5152  multiple resistance and pH regulation protein F  36.14 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0982  multiple resistance and pH regulation protein F  32.93 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.739743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5077  multiple resistance and pH regulation protein F  36.14 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4612  multiple resistance and pH regulation protein F  36.14 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2488  multiple resistance and pH regulation protein F  28.92 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000414  Na(+) H(+) antiporter subunit F  34.18 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0733  multiple resistance and pH regulation protein F  35 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.130974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1770  Na(+)/H(+) antiporter subunit F  38.67 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1158  multiple resistance and pH regulation protein F  30 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0405  hypothetical protein  38.67 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.38 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0152  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  26.58 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1125  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  37.1 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000095206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0578  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.93 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00573992  decreased coverage  0.00947424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  27.85 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1520  multiple resistance and pH regulation protein F  34.15 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0106021  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3475  potassium efflux system protein PhaF  30.12 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3986  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  29.17 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1005  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.67 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000446715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0879  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.29 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00982664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3223  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.44 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1587  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.1 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3719  multiple resistance and pH regulation protein F  27.78 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2810  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.65 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3256  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  28.92 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3314  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  31.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0493  multisubunit Na+/H+ antiporter, subunit F  30.12 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2860  multiple resistance and pH regulation protein F  33.75 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.139125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1445  multiple resistance and pH regulation protein F  31.17 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0502  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000119623  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3690  multiple resistance and pH regulation protein F  29.27 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.973299 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0899  multiple resistance and pH regulation protein F  27.16 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.857013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3814  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  25.3 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.345278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2523  multiple resistance and pH regulation protein F  35.38 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0488  multiple resistance and pH regulation protein F  34.57 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.675094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2095  multiple resistance and pH regulation protein F  34.21 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.801708  normal  0.210838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0753  multiple resistance and pH regulation protein F  32.93 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0206212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2714  multiple resistance and pH regulation protein F  32.86 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2932  multiple resistance and pH regulation protein F  37.93 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3447  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  34.38 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.810959  normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0869  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  35.38 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0662572  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3809  multiple resistance and pH regulation protein F  26.76 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.332403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0865  multiple resistance and pH regulation protein F  32.56 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.717084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1354  monovalent cation/proton antiporter, pH regulation subunit F  25.37 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.8 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.735692  normal  0.139812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3227  multiple resistance and pH regulation protein F  35.48 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142719  normal  0.055073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1006  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.762364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2658  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  30.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3514  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.71 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2226  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.71 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3453  multiple resistance and pH regulation protein F  35.48 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.592211  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  33.71 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689524  normal  0.0371902 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3711  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.39 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0385  multiple resistance and pH regulation protein F  33.33 
 
 		 88 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0828098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000708898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0565  multiple resistance and pH regulation protein F  33.73 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.4041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0533  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit F  32.05 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.567164  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3452  multiple resistance and pH regulation protein F  34.21 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0079  multiple resistance and pH regulation protein F  29.23 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4733  multiple resistance and pH regulation protein F  34.18 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1601  multiple resistance and pH regulation protein F  29.69 
 
 		 92 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1279  Na+/H+ antiporter  32.84 
 
 		 137 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.981373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>