More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1805 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1805  transport system permease protein  100 
 
 		 334 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4083  transport system permease protein  57.75 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00175195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10160  ferric enterobactin transport protein FepD  69.84 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0016497  normal  0.782861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3151  transport system permease protein  61.78 
 
 		 354 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00069111  hitchhiker  0.00000000474317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0306  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  48.52 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4231  ferric vibriobactin ABC transporter permease protein  49.68 
 
 		 344 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866695  normal  0.0198027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02570  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.01 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.103691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0331  transport system permease protein  48.56 
 
 		 334 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0851  transport system permease protein  43.96 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7986  ABC transporter, permease, Fe3+-siderophore transport system  47.71 
 
 		 350 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121274  normal  0.17606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  42.86 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1326  transport system permease protein  44.88 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2438  transport system permease protein  49.84 
 
 		 363 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal  0.566289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5336  transport system permease protein  46.18 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1241  transport system permease protein  49.68 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00596239  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1623  transport system permease protein  47.43 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3467  transport system permease protein  47.57 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743348  hitchhiker  0.00246309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0356  transport system permease protein  48.09 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1497  transport system permease protein  44.03 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0836152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37320  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  46.1 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3730  transport system permease protein  41.69 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0338  ABC-type Fe3+-siderophore transport system inner membrane subunit  45.75 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4295  transport system permease protein  47.67 
 
 		 347 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3637  transport system permease protein  40 
 
 		 340 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  normal  0.0127485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0464  transport system permease protein  40.31 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1450  transport system permease protein  50 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.011037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1524  transport system permease protein  41.59 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4289  transport system permease protein  46.95 
 
 		 354 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993131  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  41.77 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  41.77 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2086  transport system permease protein  41.05 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.180942  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3734  transport system permease protein  46.25 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1122  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.13 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.122202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3758  transport system permease protein  45.37 
 
 		 364 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4040  transport system permease protein  42.28 
 
 		 344 aa  198  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0425  transport system permease protein  40.74 
 
 		 335 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.639871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5947  transport system permease protein  45.24 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2826  transport system permease protein  46.04 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2423  transport system permease protein  44.94 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00075804  normal  0.0291277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1630  transport system permease protein  47.88 
 
 		 356 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3934  transport system permease protein  44.18 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5055  transport system permease protein  47.64 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2939  transport system permease protein  42.14 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3036  transport system permease protein  46.08 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36340  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.22 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5748  transport system permease protein  44.92 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0644  transport system permease protein  41.56 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2581  transport system permease protein  42.32 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.474869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0675  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.75 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0641  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.75 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0492  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.75 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3424  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.05 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.320644  normal  0.302372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2553  transport system permease protein  46.62 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0828136  normal  0.763173 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00557  iron-enterobactin transporter subunit  46.08 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.08 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4906  transport system permease protein  46.28 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3054  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.08 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00546  hypothetical protein  46.08 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0610  iron-enterobactin transporter membrane protein  46.08 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2206  transport system permease protein  45.51 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0665344  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19090  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.17 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0971068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2435  transport system permease protein  40 
 
 		 340 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  unclonable  0.00000000058625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2689  transport system permease protein  50 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0405482  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0616  iron compound ABC transporter permease protein  35.4 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0582  iron compound ABC transporter permease  35.4 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000513454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0671  iron compound ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1714100000000002e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0526  iron compound ABC transporter, permease  36.31 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0744  iron compound ABC transporter, permease protein  36.31 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000162191  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7290  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  44.07 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0526  iron compound ABC transporter, permease  36.31 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.8853300000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1986  transport system permease protein  39.65 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.21 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.21 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  45.21 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20810  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  41.93 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00921344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.74 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2669  transport system permease protein  42.81 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2742  transport system permease protein  45.31 
 
 		 366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00162968  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  44.88 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0142  transport system permease protein  47.09 
 
 		 354 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0105  transport system permease protein  34.94 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2492  transport system permease protein  41.55 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.3582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0530  transport system permease protein  36.62 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00110825  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0101  transport system permease protein  34.94 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000423595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2748  transport system permease protein  44.44 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3528  transport system permease protein  43.27 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0903182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2591  transport system permease protein  41.69 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.35861  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3332  transport system permease protein  44 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3060  transport system permease protein  44.24 
 
 		 392 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3138  transport system permease protein  43 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00514347  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0653  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000463622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0414  transport system permease protein  47.44 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4684  iron compound ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.055956  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06480  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.42 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3523  transport system permease protein  47.31 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  39.63 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2172  transport system permease protein  44.48 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0830561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1807  transport system permease protein  42.51 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2265  transport system permease protein  40.21 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>