34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2346 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.435798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2646  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2347  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2346    100 
 
 		 5513 bp  10930    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2297  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0193891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 1481 bp  2936    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  90.53 
 
 		 3603 bp  3489    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  88.24 
 
 		 2328 bp  607  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  97.59 
 
 		 3561 bp  521  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  85.29 
 
 		 804 bp  111  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  84.89 
 
 		 1302 bp  109  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  83.33 
 
 		 4746 bp  91.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  88.75 
 
 		 3150 bp  87.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2341    84.48 
 
 		 117 bp  87.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  83.09 
 
 		 960 bp  87.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  83.62 
 
 		 3573 bp  79.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  87.18 
 
 		 3195 bp  75.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0049    82.5 
 
 		 1454 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.778115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0377  transposase IS4 family protein  82.5 
 
 		 990 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1580    85.23 
 
 		 1487 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1538    85.23 
 
 		 1487 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.313692  normal  0.492154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1456  transposase IS4 family protein  82.5 
 
 		 990 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1455    85.23 
 
 		 3177 bp  71.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0686347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  88.89 
 
 		 2898 bp  69.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  95 
 
 		 3162 bp  63.9  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  83.75 
 
 		 3072 bp  56  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  83.75 
 
 		 2883 bp  56  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  83.75 
 
 		 3024 bp  56  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  84.21 
 
 		 3135 bp  56  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0378    80.67 
 
 		 499 bp  54  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1457  hypothetical protein  80.67 
 
 		 498 bp  54  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.442942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  87.76 
 
 		 3135 bp  50.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  90.24 
 
 		 3552 bp  50.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>