13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0378 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0049    98.72 
 
 
1454 bp  856    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.778115  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0378    100 
 
 
499 bp  989    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1455    99.6 
 
 
3177 bp  965    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0686347  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1457  hypothetical protein  99.6 
 
 
498 bp  965    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.442942  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1538    99.6 
 
 
1487 bp  965    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.313692  normal  0.492154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1580    99.6 
 
 
1487 bp  965    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0120  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1413  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.435798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1922  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0193891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2297  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2346    80.67 
 
 
5513 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2347  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2646  hypothetical protein  80.67 
 
 
1481 bp  54  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>