29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1065 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  54.46 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  47.27 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  45.87 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  47.17 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  55.34 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  43.56 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  45.26 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  44.68 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  47.75 
 
 		 111 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  46.84 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  47.25 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  31 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  35.11 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  35.48 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  42.86 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  40 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  40 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  40.58 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  31.52 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  25.93 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  47.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  47.27 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  31.03 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  37.25 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  32.35 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  26.25 
 
 		 79 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  39.13 
 
 		 166 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  39.13 
 
 		 166 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>