23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0950 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  100 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  58.33 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  54.13 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  63.64 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  55.45 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  67.57 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  63.39 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  58.65 
 
 		 125 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  44.86 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  48.96 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  56.58 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  50.93 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  38 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  39.13 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  37.23 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  28.28 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  37.31 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  34.72 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  37.84 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  32 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  34.07 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  37.14 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>