26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2334 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 		 111 aa  221  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  71.17 
 
 		 111 aa  146  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  63.39 
 
 		 110 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  59.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  54.13 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  52.83 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  46.79 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  61.64 
 
 		 163 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  52.21 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  48.42 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  41.96 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  47.96 
 
 		 95 aa  90.5  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  37.11 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  45.83 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  33.33 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  38.75 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  40 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  37.33 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  40 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  32.88 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  29.89 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  46.15 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  40.74 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  40.74 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>