30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1659 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 
163 aa  321  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  51.79 
 
 
110 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  51.49 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  47.71 
 
 
126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  50 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  45.16 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  41.23 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  55.34 
 
 
111 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  48.62 
 
 
111 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  49.07 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  45.65 
 
 
106 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  35.77 
 
 
130 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  46.15 
 
 
95 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  39.78 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  47.46 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  31.68 
 
 
105 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  45 
 
 
105 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  41.94 
 
 
104 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  50 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  50.79 
 
 
97 aa  51.2  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  40 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  55.56 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  33.96 
 
 
92 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  43.1 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  39.68 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  39.68 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  39.68 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  39.68 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  39.68 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  39.68 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>