23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0890 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  100 
 
 		 111 aa  227  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  55.45 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  44.95 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  48.98 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  47.47 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  44.55 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  46.79 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  54.65 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  56.16 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  46.79 
 
 		 111 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  50.57 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  39.42 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  33.73 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  33.73 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  30.61 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  32 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  39.29 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  38.18 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  37.5 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  32.81 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  32.26 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  38.98 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  44.44 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>