34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0628 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  48.1 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  46.05 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  44.74 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  41.25 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  46.75 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  43.42 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  43.59 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  46.43 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  40.26 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  44.87 
 
 		 89 aa  57  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  38.57 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  37.31 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  34.62 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  38.46 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  32.14 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  32.81 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  32.05 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  38.98 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  30.43 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3158  hypothetical protein  42.65 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  44.26 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  34.55 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  36.76 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  36.49 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1033  hypothetical protein  35.71 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.24218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  34.72 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0120  ATP synthase protein I  36.51 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  27.27 
 
 		 96 aa  40  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>