33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3140 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  159  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  67.11 
 
 
79 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  63.77 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  48.72 
 
 
80 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  55.7 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  55.13 
 
 
81 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  49.35 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  45.68 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  40 
 
 
92 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  40.58 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  47.37 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  40.26 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  37.97 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  34.72 
 
 
87 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  31.75 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  39.68 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  44.83 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  35.82 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  34.67 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  35.21 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0939  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0413786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  30.88 
 
 
111 aa  43.9  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0578  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.714633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  44.9 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  38.71 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1326  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  36.25 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  39.34 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  38.46 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1108  hypothetical protein  41.82 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  48.33 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  42.62 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  35.42 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>