38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0336 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  81.82 
 
 		 89 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  62.96 
 
 		 80 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  62.96 
 
 		 80 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  64.86 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  73.08 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  58.11 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  42.68 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  46.75 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  43.59 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  37.97 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  43.24 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  37.5 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  40 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  36.25 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  32.47 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  38.81 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  51.22 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  38.18 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  37.97 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  30.77 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  38.18 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  32.5 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  39.62 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  32.79 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  34.85 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0939  hypothetical protein  44.68 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0413786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  40.68 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  36.67 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  36.67 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  44.19 
 
 		 145 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0120  ATP synthase protein I  44.44 
 
 		 72 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>