54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3823 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  283  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  49.58 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  40.86 
 
 
123 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  43.62 
 
 
106 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.75 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  43.86 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.84 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  35.65 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  39 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  39.58 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  42 
 
 
112 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  38.04 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.15 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  40.22 
 
 
125 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  45.45 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  35.19 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  37.86 
 
 
132 aa  58.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  37.86 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  37.23 
 
 
106 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.89 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  34.17 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  39.8 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  35.54 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  32.48 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  40 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  48.33 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  46 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  32.97 
 
 
113 aa  52  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  45.28 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  33.33 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  33.82 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  44.83 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  44.44 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.46 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  49.12 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  48.78 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1281  hypothetical protein  37.04 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0902065  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  29.91 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  35.94 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  43.1 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  45.16 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  47.73 
 
 
78 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.65 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.65 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  41.51 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  45.24 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  44.19 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  34.85 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  28.81 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  41.67 
 
 
110 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.285856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>