36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3929 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  157  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  98.75 
 
 		 80 aa  157  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  68.35 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  60.26 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  72 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  62.96 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  48.72 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  48.68 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  39.02 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  44.74 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  40 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  40.58 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  39.73 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  33.33 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  32.47 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  36.51 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  39.34 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  36.84 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  33.82 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  48.72 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  35.71 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  34.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  31.15 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  37.31 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  36.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  31.03 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  36.84 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  32.31 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0120  ATP synthase protein I  40.91 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  33.82 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>