33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4246 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  72 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  70.67 
 
 		 80 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  64.94 
 
 		 78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  73.08 
 
 		 81 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  54.67 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  71.23 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  49.35 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  44 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  44 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  41.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  42.86 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  35.44 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  35.21 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  35.44 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  30.99 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  37.93 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  52.63 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  27.91 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  30.99 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  33.78 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  32.89 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  45 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  36.23 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  31.08 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  34.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  32.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  29.41 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  32.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  40.91 
 
 		 127 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>