35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1315 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  100 
 
 
106 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  51.43 
 
 
106 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1075  FoF1 ATP synthase, subunit I  63.33 
 
 
106 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  32.73 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  35.23 
 
 
119 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  32.41 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  31.48 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  31.86 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  35.42 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  35.71 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  31.87 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  31.82 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  45.83 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.38 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  31.82 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  45.83 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  32.63 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  31.91 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  32.91 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  31.82 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  37.04 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4376  putative ATP synthase protein I  34.69 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  35.16 
 
 
123 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  28.74 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  33.33 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  37.25 
 
 
111 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  37.23 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  32.08 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  28.74 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  31.03 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  38 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  29.41 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  31.82 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  28.57 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>