27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1509 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  70.13 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  67.11 
 
 		 80 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  55.84 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  54.55 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  54.67 
 
 		 93 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  58.11 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  54.67 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  48 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  43.42 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  38.96 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  39.71 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  36.99 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  31.65 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  35.62 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  37.7 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  41.79 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  34.48 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  44.26 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  42.59 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  47.83 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  37.33 
 
 		 120 aa  43.5  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  33.85 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  42.55 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  44.83 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>