49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2595 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  55 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  58.93 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  56.82 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  44.14 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  45.83 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  45.83 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.69 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  38.05 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.56 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  31 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  34.94 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  34.26 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  31.4 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  40.45 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  37.78 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  46.43 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  36.73 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  33.68 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  34.69 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  47.17 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  43.08 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  34.31 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  32.94 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  29.67 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  30.84 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  30.84 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  48 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  35.16 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  35.16 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  38.33 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  34.07 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4376  putative ATP synthase protein I  28.72 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  30.19 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  47.17 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  42.59 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  38.46 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.07 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  32.22 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  45.1 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  31.03 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  36 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  36.36 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  39.34 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1211  hypothetical protein  31.18 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>