27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4376 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4376  putative ATP synthase protein I  100 
 
 
116 aa  229  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  39.73 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  33.63 
 
 
115 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  29.09 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  35.62 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  37.04 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  35.62 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  34.69 
 
 
106 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  38.89 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  32.26 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  36.23 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  30.61 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  33.33 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  33.33 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.67 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  34.48 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  34.09 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.58 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.58 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  32.95 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  39.29 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  32.95 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  34.88 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  30.56 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  31.96 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>