46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0446 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  68.63 
 
 
110 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  62.39 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  55 
 
 
115 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  51.28 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  52.83 
 
 
132 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  46.3 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  51.35 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  51.89 
 
 
132 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  51.61 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  50.54 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  50.54 
 
 
121 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  44.34 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  45.05 
 
 
126 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  44.9 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  40.74 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  36.61 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  43.88 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  42.86 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  41.11 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  51.67 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  35.23 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  31.52 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  42.25 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  39.8 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  33.64 
 
 
113 aa  53.9  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  43.08 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  35.42 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  36.78 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  29.6 
 
 
120 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  29.85 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  29.41 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  45.45 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4376  putative ATP synthase protein I  30.61 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  28.81 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  28.81 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  31.18 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  40.86 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2200  ATP sythase protein I, putative  44.87 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.383605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  29.33 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  34.25 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  35.38 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  30.91 
 
 
71 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  42.86 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>