44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7656 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  255  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  88.89 
 
 
125 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  65.79 
 
 
124 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3371  conserved hypothetical proteinn  62.73 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0949448  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3500  hypothetical protein  59.66 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  58.82 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  43.7 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  43.01 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  45.05 
 
 
119 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  45.26 
 
 
127 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  42.24 
 
 
127 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  40.54 
 
 
132 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  40.54 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  37.04 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  48.1 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  38.66 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  39.47 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  39.25 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  34.48 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  57.41 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  35.45 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  37.82 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  47.17 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  38.46 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  33.04 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  40.74 
 
 
141 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  37.78 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  38.83 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  46.43 
 
 
123 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  35.71 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  31.82 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  38.04 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  33.64 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  36.49 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  35 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  35 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  34.85 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2200  ATP sythase protein I, putative  39.6 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.383605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  43.14 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  33.9 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  40.43 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4376  putative ATP synthase protein I  32.29 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  43.33 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>