22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0333 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  184  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  55.84 
 
 
82 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1281  hypothetical protein  42.5 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0902065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0753  hypothetical protein  33.75 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  21.95 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0578  hypothetical protein  39.73 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.714633  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  35.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  25.68 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  32.39 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  26.39 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  27.87 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  22.67 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  26.25 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  31.75 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  26.03 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  26.6 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  26.67 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  24.14 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  27.4 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  25.93 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  25.93 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>