34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19690 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  100 
 
 
95 aa  184  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  66.29 
 
 
103 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  60.61 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  63.92 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  71.01 
 
 
104 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  69.05 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  69.05 
 
 
121 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  67.16 
 
 
162 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  65.71 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  73.13 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  73.13 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  73.13 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  73.13 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  73.13 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  73.13 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  50 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  38.95 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  40.54 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  28.72 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  30.93 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  37.84 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  50 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  28.72 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  53.12 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  40 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  32.58 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  29.73 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  23.61 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  33.9 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  35.71 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  28 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  28.16 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  26.74 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>