30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1881 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  74.29 
 
 		 105 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  72.34 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  77.63 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  68.49 
 
 		 162 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  63.92 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  74.29 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  71.23 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  71.23 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  71.23 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  71.23 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  71.23 
 
 		 163 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  71.23 
 
 		 162 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  45.45 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  58.33 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  58.33 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  29.9 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  34.41 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  30.48 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  31.63 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  34.62 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  46.03 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  43.96 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  35.56 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  32.04 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  45.45 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  32.69 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  30.34 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  31.68 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  33.98 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>