24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2670 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  48.8 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  50.93 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  50.98 
 
 		 112 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  50.45 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  57.14 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  53.98 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  52.21 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  39.52 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  39.42 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  43.82 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  50.62 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  55.93 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  31.82 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  33.64 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  39.06 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  37.5 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  37.93 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  35.38 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  28 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  35.09 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  41.03 
 
 		 134 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  29.89 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  32.98 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>