30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0437 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  100 
 
 		 95 aa  186  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  38 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  39.39 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  42.39 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  47.96 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  43.75 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  54.24 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  33.73 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  38.37 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  37.5 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1163  F0F1-ATPase subunit, putative  42.86 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.153362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  35.16 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  36.05 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  38.95 
 
 		 95 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2670  F0F1-ATPase subunit, putative  55.93 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  39.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  39.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  36.23 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  35.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  35.62 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  30.95 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  39.39 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  39.06 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  37.14 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  37.14 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  37.14 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  37.14 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  37.14 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  37.14 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  39.34 
 
 		 97 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>