24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4099 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4099  ATP synthase gene 1, putative  100 
 
 		 121 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000538142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3931  hypothetical protein  98.35 
 
 		 121 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  68.6 
 
 		 95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  54.55 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  64.29 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5558  F0F1-ATPase subunit  62.86 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0421  ATP synthase gene 1, putative  61.19 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1881  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  62.12 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2775  putative H(+)-transporting ATP synthase, gene 1 protein  57.35 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17822  normal  0.523023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  39.64 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2792  putative ATP synthase subunit  65.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.975786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2650  putative ATP synthase subunit  65.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1292  putative ATP synthase gene 1  65.67 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0149  putative ATP synthase gene 1  65.67 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1054  F0F1-ATPase subunit, putative  65.67 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124.1  putative ATP synthase gene 1  65.67 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  39.77 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  39.02 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  25.66 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1438  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  51.11 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  35.14 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  30.11 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  26.88 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2334  F0F1-ATPase subunit, putative  43.4 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>